Arrêt travail Cas contact

Bonjour, 
Je suis contractuelle depuis moins de 3 mois dans la fonction publique territoriale. J'ai dû me mettre 4 jours en arrêt maladie car j'étais cas contact (3 jours d'isolement sur mes congés et 4 jours sur mes jours de travail). Cependant, je ne comprends pas l'indemnisation. C'est 50% du salaire versé par la sécu c'est ça ? Comment fait-on pour le reste ??
On nous oblige à nous isoler et à manquer le travail, mais on perd 50% de notre salaire et on ne peut rien faire ? L'indemnité n'est pas augmentée dans ces cas là ?

Merci pour votre réponse.