Remboursement Navigo, avant ou après l'impôt à la source?

J'ai un doute concernant la position d'un élément sur ma fiche de paie.

Je vois la ligne de remboursement de transport en commun (pass Navigo) être ajouté avant le prélèvement à la source. Il sert donc dans la base de calcul pour le net à payer avant impôt sur le revenu. 

Or, un certain nombre d'articles précisent que le remboursement Navigo est considéré comme un frais professionnel et se faisant, exonéré d'impôt sur le revenu.

D'autres sites (comme celui-ci: help.payfit.com) précisent même que l'ajout du remboursement est la retenue liée à l'impôt sur le revenu. 

Qu'en pensez-vous? 

Merci :)