Prolongation d'un arrêt de travail pour maladie : durée et indemnisation

1. Quand aller chez le médecin pour faire prolonger l'arrêt de travail initial ?

Tout salarié peut avoir besoin de prolonger son arrêt de travail lorsqu'il estime que son état de santé ne lui permet pas de reprendre son activité professionnelle.

Dans ce cas, il est important de prendre rendez-vous chez son médecin traitant avant la date de fin de l'arrêt initial, afin d'éviter toute interruption de la couverture des indemnités journalières. Le médecin, après évaluation de l'état de santé du salarié, pourra délivrer une prolongation de l'arrêt si nécessaire. De son côté, le salarié devra ensuite transmettre ce nouvel arrêt à son employeur ainsi qu'à la Sécurité sociale, dans les délais impartis, pour que ses droits soient maintenus.

💡Bon à savoir : depuis le 1er septembre 2026, la durée d’une prolongation d’arrêt de travail est en principe limitée à 62 jours. Cette durée peut être dépassée lorsque l’état de santé du salarié le justifie (1).

2. Un arrêt de travail peut-il être prolongé par un autre médecin ?

En principe, seul le médecin qui a prescrit l'arrêt de travail initial ou votre médecin traitant peut établir une prolongation (2).

Néanmoins, dans certains cas exceptionnels, votre arrêt maladie peut être prolongé par un autre médecin (3) :

• par le remplaçant du médecin qui vous a prescrit votre arrêt initial ;
• par le remplaçant de votre médecin traitant ;
• par un spécialiste consulté à la demande de votre médecin traitant ;
• à l'occasion d'une hospitalisation.

💡 À savoir : depuis le 1er janvier 2024, lorsque la consultation a lieu par acte de télémédecine, la prescription ou le renouvellement d'un arrêt de travail (4) :

• ne peut porter sur plus de 3 jours ;
• ni avoir pour effet de porter à plus de 3 jours la durée d'un arrêt de travail déjà en cours.

Il n'est fait exception à cette règle que :

• lorsque l'arrêt de travail est prescrit ou renouvelé par le médecin traitant ou la sage-femme référente ;
• ou en cas d'impossibilité, dûment justifiée par le patient, de consulter un professionnel médical compétent pour obtenir, par une prescription réalisée en sa présence, une prolongation de l'arrêt de travail.

3. Quelles démarches effectuer en cas de prolongation de l'arrêt maladie ? 

Lorsque le médecin prolonge votre arrêt maladie, vous devez transmettre les volets n°1 et 2 à la Caisse primaire d'assurance maladie (CPAM) à laquelle vous êtes rattaché (5).

Pensez également à transmettre le volet n°3 de l'avis de prolongation à votre employeur.

💡Depuis le 1er juillet 2025, l'usage d'un formulaire comportant 7 points sécurisés est obligatoire pour tout envoi d'avis d'arrêt de travail papier (6).

4. Quel délai pour l'envoi d'une prolongation d'arrêt de travail  ? 

Vous disposez d'un délai de 2 jours ouvrables suivant la date de prescription de la prolongation pour le transmettre à l'assurance maladie.

La transmission de votre avis de prolongation à la CPAM conditionne le versement de vos indemnités journalières.

👉  Ainsi, en cas d'envoi tardif de l'avis de prolongation à la CPAM, la caisse vous informera du retard constaté et de la sanction à laquelle vous vous exposez en cas de récidive dans les 24 mois qui suivent (7).

À moins que vous ne soyez hospitalisé ou en mesure d'établir votre impossibilité d'envoyer votre avis de prolongation dans le délai requis, le montant des indemnités journalières, correspondant à la période écoulée entre la date de prescription de l'arrêt de prolongation et la date d'envoi, est réduit de 50 %.

Par ailleurs, vous disposez également d'un délai de 48 heures pour transmettre le volet n°3 à votre employeur mais votre convention collective peut prévoir d'autres dispositions.

En revanche, le fait pour un salarié de ne pas justifier de la dernière prolongation de son arrêt de travail, ne constitue pas une faute grave à partir du moment où il avait informé son employeur de l'arrêt initial.

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5. Peut-on scanner une prolongation à son employeur et envoyer l'arrêt de travail par mail ?

Si la pratique est relativement récente, de nombreuses entreprises acceptent que leurs salariés scannent leur arrêt de prolongation et leur transmettent par mail.

Cependant, il est recommandé de vérifier auprès de son employeur si cette modalité est acceptée et conforme aux procédures internes. Notez également que la transmission de l'arrêt de travail original à la Sécurité sociale reste obligatoire, soit par voie postale, soit via le téléservice dédié si disponible.

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6. Quelle indemnisation allez-vous obtenir en cas de prolongation de l'arrêt maladie ?

Lorsque vous êtes en arrêt pour maladie d'origine non professionnelle, la CPAM vous verse, si vous remplissez les conditions, au maximum 360 jours d'indemnités journalières par période de 3 ans consécutifs, sauf si vous souffrez d'une affection de longue durée (ALD) (8).

Ainsi, si vous n'avez pas épuisé vos droits, la CPAM continuera à vous verser des indemnités journalières. Celles-ci sont égales à 50% de votre salaire journalier de base (9).

En complément, vous pouvez percevoir des indemnités complémentaires de la part de votre employeur. C'est ce que l'on appelle le maintien de salaire (10).

La durée de versement des indemnités complémentaires varie en fonction de votre ancienneté au sein de l'entreprise (11).

En cas de prolongation de l'arrêt initial, ces indemnités complémentaires continueront elles aussi à être versées si vous remplissez les conditions exigées.

💡Bon à savoir : dans un arrêt du 10 septembre 2025, la Cour de cassation a reconnu que "Puisque la maladie l’empêche de se reposer, le salarié placé en arrêt pendant ses congés payés a droit à ce qu’ils soient reportés. Il faut toutefois que l’arrêt maladie soit notifié par le salarié à son employeur. " (12).

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7. Combien de jours de carence pour être indemnisé en cas de prolongation de l'arrêt maladie ? 

Lorsque l'on vous prescrit un arrêt pour maladie non professionnelle, un délai de carence de 3 jours s'applique pour percevoir des indemnités journalières. Concrètement, la CPAM vous verse des indemnités journalières à compter du 4ème jour de votre arrêt.

Néanmoins, aucun délai de carence ne s'applique en cas de prolongation.

Il n'y a pas non plus de délai de carence dans les cas suivants :

• en cas de reprise d'activité entre 2 arrêts de travail n'ayant pas dépassé 48 heures ;
• en cas d'arrêts successifs liés à une affection de longue durée (ALD) : le délai de carence ne s'applique que pour le premier arrêt.

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8. Quelles sont vos obligations pendant une prolongation ?

Pendant toute la durée de votre prolongation, vous restez soumis aux mêmes obligations que celles applicables pendant votre arrêt de travail initial, à savoir :

• respecter les prescriptions de votre médecin ;
• respecter les horaires de sorties autorisées ;
• vous soumettre aux divers examens et contrôles médicaux organisés par la CPAM et votre employeur ;
• n'exercer aucune autre activité professionnelle.

En cas de manquement à vos obligations, le versement de vos indemnités journalières peut être suspendu.

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