Etudiant en alternant en contrat d'apprentissage - Maternité

 je suis en formation en alternance (cdd particulier) dans une école privé et j'ai signé un contrat de 2 ans au sein d'une entreprise.
Je suis enceinte de 7 mois et demi et j'ai bientôt mon congé maternité. L'école m'avait assuré que je pouvais rattraper mes examens à mon retour et pendant mon absence. A M-1, l'école m'indique qu'il va falloir m'inscrire en candidat libre l'année prochaine pour repasser l'année, et je vais devoir payer l'école. Or, ils indiquent qu'il y a des conditions d'assuidité à respecter mais ce sont des absences volontaires et non un arrêt maladie. Je risque donc de ne pas avoir l'entièreté de mon diplôme si je ne suis pas en candidat libre l'année prochaine. Qu'en pensez-vous ?