Résiliation judiciaire de mon contrat de travail

Bonjour,

Je suis assitante médico-administrative depuis 2004 et tehnicienne en neurophysiologie depuis 2006 au sein d'un cabinet médical. J'exerce donc 2 fonctions bien distinctes dans la même entreprise. Je suis diplômée en tant qu'assistante médico-administrative et j'ai été formée sur place pour assurer les examens médicaux mais sans avoir la qualification exigée pour normalement les réaliser. J'ai perçu mon salaire d'assistante médico-administrative et aucun salaire en tant que technicienne MAIS en compensation si je peux appeler cela ainsi, je bénéficiais d'une prime au semestre pour les examens effectués ce qui ne vaut absoluement pas le salaire d'un technicien en neurophysiologie (il faut être infirmier avec une spé ou manipulateur en radiologie avec une spé...). Cette situation a perduré dans le temps. Cependant, je suis actuellement en congé sans solde suite à mon congé parental car je ne souhaite pas reprendre dans de telles conditions. Une contrôleuse du travail m'a conseillé de saisir le conseil des prud'hommes par une rupture d'acte. Seulement, étant donné que la situation perdure depuis des années, j'ai bien peur que cela soit en ma défaveur. Après recherche, j'ai découvert qu'il existe aussi la résiliation judiciaire du contrat. Je précise que ce qui m'a en quelque sorte "réveillée" est sa récente proposition que j'ai refusée. J'ai tenté de convenir d'un accord pour une rupture conventionnelle. Sa condition était de me faire le chèque correspondant au montant de mes indemnités et de lui rendre la somme en espèce après encaissement...ce qui est aussi totalement illégal j'en suis consciente. Ma question est donc pensez-vous que cela soit en ma faveur si j'entame de telles démarches ? Je peux receuillir le témoignage de certains patients à qui j'ai réalisé des examens et ma collège remplaçante est dans la même situation et souhaite partir le plus vite possible (elle est dans l'entreprise depuis mon congé maternité de 2019) Mon CDI est actuellement suspendu en raison de mon congé sans solde.
Je vous remercie pour vos précieux conseils.